Het bezoekerscentrum werkt graag samen met organisaties in de regio. Samen realiseren wij activiteiten op het gebied van natuur, landschap, cultuurhistorie, tuinflora, fauna, milieu en duurzaamheid. Onze partners maken gebruik van het centrum voor hun eigen werkzaamheden en zetten kennis en ervaring in bij het gezamenlijke opzetten en aanbieden van activiteiten.
Natuurvereniging IVN Alphen aan den Rijn en omstreken verzorgt met name de natuureducatie door het organiseren van lezingen, cursussen, excursies en jeugdactiviteiten.
De Stichting Kinderopvang Alphen aan den Rijn gebruikt gebouw de vlinder 3 middagen per week voor de huisvesting van zijn thema BSO Natuur en Milieu. Kinderen van 8-12 jaar komen na school naar de SKA locatie de PaddenPoel en pikken daar spelenderwijs ook allerlei interessante dingen over de omliggende natuur op. Dat gebeurt via de wekelijkse inzet van gediplomeerde IVN natuurgidsen.